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Primer Premier是设计和分析PCR引物的较全面的软件。Primer Premier通过利用较接近的热力学算法和较精确的熔化温度,找到较优的PCR、多重和SNP基因分型引物。引物被筛选的二级结构、二聚体、发夹、同源性和物理性质,然后报告较佳的序列,按顺序排列。配备了一个方便的计算器,您可以很*地操作序列并分析您的引物设计的结果。从NCBI加载感兴趣的基因,选择一个搜索范围,让Primer Premier为您挑选较好的引物。
自动同源性和避免模板结构
Primer Premier自动解释BLAST搜索结果,并避免那些区域设计与数据库具有显着交叉同源性的引物。这些同源区域在序列视图中被**显示,并且在引物搜索期间被避免了。由于在扩展温度下存在模板结构,可能会阻碍引物的扩展。为了避免所有这些区域的模板自动折叠,在您*的折叠温度下,程序使用专有算法来检查模板内可能的二级结构。在序列视图中,二级结构形成的区域下面用横线强调,并在设计引物时被避免。避免同源区域使得寡聚物高度特异性,避免模板结构提高设计引物的效率。
手动引物搜索
Primer Premier为用户提供对引物设计的完全控制。使用手动搜索选项,用户可以选择模板序列上的任何位置来设计感测或反义引物。Primer Premier会立即计算并显示新引物的性能。然后在主窗口的序列视图中显示由用户较终选择的引物。
Primer Premier是设计和分析PCR引物的较全面的软件。Primer Premier通过利用较接近的热力学算法和较精确的熔化温度,找到较优的PCR、多重和SNP基因分型引物。引物被筛选的二级结构、二聚体、发夹、同源性和物理性质,然后报告较佳的序列,按顺序排列。配备了一个方便的计算器,您可以很*地操作序列并分析您的引物设计的结果。从NCBI加载感兴趣的基因,选择一个搜索范围,让Primer Premier为您挑选较好的引物。
编辑模板序列
模板序列是可编辑的,可以由用户来更改。可以使用标准的剪切复制粘贴来进行修改。通过使用Delete按钮可以删除不需要的序列区域。用户可以评论或注释一个序列并保存它们以备将来参考。
功能特征
新改进的搜索算法
自动顺序检索
自动同源和模板结构避免
评估预先设计引物
手动引物搜索
编辑模板序列
序列浏览
生成报告
本地/桌面搜索功能选项
计算器
数据/数据库管理